早期肠癌的5年生存率可以达到90%，即早期肠癌的预后较好，5年生存率90%意味着100个早期肠癌患者，有90个可以活过5年。早期肠癌的临床分期应该属于Ⅰ期肠癌，就是肿瘤侵犯到黏膜、黏膜下层，而没有局部区域淋巴结转移，也没有远处转移。在肠癌最常见的TNM分期中，属于T1-T2、N0、M0。
目前为止，大多数早期肠癌均能得到临床治愈，还能长期生存，所以肠癌的预后与临床分期密切相关。早期肠癌5年生存率90%，但是到进展期肠癌5年生存率，通常只有50%-70%。所以肠癌诊断越早，经过及时治疗预后越好。经过正规治疗，早期肠癌通常均能够长期生存，获得临床治愈。
