艾灸与针灸可同时进行，艾灸属于温热治疗方法，主要有温通经络、活血化瘀及壮阳、补阳作用；针刺主要有疏通经络、调理气机作用，二者没有冲突可同时操作。若疾病需进行温通治疗时，还可应用温针灸方法，即在针上插一段艾灸，将针刺入穴位，再点燃针柄上的艾灸条，对于类风湿关节炎患者手指关节肿胀、疼痛有较好疗效。

通常艾灸与针灸同时进行情况比较少，因两者操作有一定差异。针刺相对比较简单，直接刺入人体即可；而艾灸有时需应用器具或医生拿艾条进行悬灸或雀啄灸等，操作比较费时，但现在可应用艾灸器具进行治疗，相对比较轻松。