大部分脑脓肿穿刺引流后，1-2周患者的脓腔基本闭合，临床症状得到改善即可考虑出院。但需强调脑脓肿治疗为相对长期的系统工程，单纯进行脓肿穿刺引流，虽然患者临床症状恢复比较快，但后续建议最好进行4-6周的正规抗炎治疗。因为抗炎治疗有助于杀死感染灶内的细菌，可有效避免脓肿复发。
如果将脓肿穿刺手术和正规的抗炎治疗合并考虑，一般患者需一个半月左右的时间才可顺利出院。但每个患者的具体情况不同，感染细菌来源不同，以及抗炎药物使用也有所差异。部分依从性较好，遵医嘱定期到医院复查的患者，也可酌情使用有针对性、强有力、敏感的口服抗生素，这类患者大概在术后2-3周即可考虑出院。
