强直性脊柱炎病因及发病机较复杂，目前认为重要原因主要分以下方面：
1、遗传背景：通过对家系及同卵双生子的研究发现，强直性脊柱炎与遗传密切相关，部分以家族性发病，但并非100%遗传给下一代，但发生几率则相对较大。常见基因为HLA-B27基因，亦存在部分非HLA-B27基因相关，临床亦可见部分HLA-B27阴性的强直性脊柱炎患者；
2、环境因素：细菌感染，如肺炎克雷伯杆菌感染或肠道部分微生物感染，可通过分子模拟机制诱发强直性脊柱炎发病。
环境因素与遗传背景因素综合作用可引起体内免疫紊乱，诱发T细胞与B细胞过度活化，可产生自身反应性T细胞存在，可引起组织损伤，导致疾病发生。
