间接喉镜如果没问题，在某些情况下，可能还需要进一步进行电子喉镜检查。两者均可对下咽部、喉部状况进行检查，但间接喉镜检查本身具有一定局限性，很多患者下咽部、喉部结构特殊，加上分泌物遮挡，通过间接喉镜检查难以完全观察清楚。而且间接喉镜需要从口腔进入，对于咽喉部较敏感、咽反射较剧烈的患者，更加难以看清楚。
而电子喉镜检查一般从鼻腔进入，对咽喉部刺激较小，前面镜头可以弯曲，比较灵活，观察范围更加全面，画面也更加清楚。电子喉镜同时具有吸引功能，一般能做到对喉部无遗漏的查看。间接喉镜无法进行组织学活检，如果喉部出现喉癌等异常病灶，仅能出具初步诊断。而电子喉镜则可通过镜身里面的活检管道，对异常病灶进行组织学活检，并且进行病理诊断。而病理诊断是确诊癌症的金标准，此时进行电子喉镜很有必要。
