房颤主要危害为存在卒中风险，尤其对于年龄较大患者风险更大，房颤卒中存在多种危险因素，其中年龄为重要危险因素之一。若患者年龄＞65岁时房颤卒中危险会比年轻患者高几倍，对于老年人而言，出现房颤后预防卒中较为重要，通常建议患者口服药物预防卒中，传统药物为华法林。华法林药物效果较好，但缺点也较为明显，即治疗窗较窄，若服用量较少时可能无效果，而服用过量后易引起出血。
目前建议患者服用新型口服抗凝剂，代谢途径以及作用机制与传统药物不同，服用时较为方便，而且出血风险也较低。此外，还可通过导管消融手术根治房颤，因引起卒中原因主要为房颤，若根治房颤后患者出现卒中风险也会逐渐降低。房颤发生血栓主要与心脏特殊结构即左心耳有关，目前存在新型治疗方法，主要通过左心耳封堵预防卒中。
