多数情况下，卵巢囊肿不会使患者出现明显症状。但在个别情况下，卵巢囊肿会使患者产生腹痛、腹胀等明显的不适反应。当卵巢囊肿并发蒂扭转，甚至卵巢囊肿破裂的情况时，会使患者产生急性腹痛、腹胀，甚至腰部坠痛感，伴发恶心、呕吐等不适反应。
其次如果卵巢囊肿是炎性肿物，有卵巢及输卵管卵巢脓肿，在其急性发炎期，会引起患者的急性腹痛、腹胀甚至发热，胃肠道不适的症状。如果卵巢囊肿，是恶性卵巢肿瘤时，在晚期浸润生长，累及神经，也会出现局部盆腔痛的表现。
因此卵巢囊肿是否疼痛，要根据疾病类型判断，例如卵巢囊肿发生蒂扭转破裂时，甚至卵巢囊肿为炎性，输卵管卵巢积脓急性期时，均可能会使患者出现明显的腹痛，甚至伴发发热等临床不适症状。
