卵巢囊肿是否严重，需查询囊肿性质。卵巢囊肿是生理性病变，无需给予相应治疗。随着时间延长，会自行消失，比如妊娠早期出现的黄体囊肿，多数无需给予任何治疗，患者也不会存在任何临床症状。随着妊娠时间逐渐延长，孕周逐渐加大，卵巢黄体囊肿可自然萎缩。针对于这一类囊肿，并非严重疾病。
但是也有一些卵巢囊肿建议手术。包括单纯卵巢囊肿、卵巢子宫内膜异位囊肿等。卵巢子宫内膜异位症频繁发生卵巢囊肿内部出血、破裂，与周围粘连，会引起痛经、不孕症等。恶性肿瘤也会表现成卵巢囊肿的形态，在进行超声检查时会有一些恶性指标。比如囊肿内部有实性结节状回声、血液循环丰富等，在进行术前检查时相应的肿瘤标志物会明显升高。部分良性子宫内膜异位囊肿也有可能转变成恶性病变，相对而言恶性肿瘤所致的囊肿，将会是较为严重的病变。
