扁桃体切除也是最常见手术，扁桃体切除常用于慢性反复扁桃体炎、扁桃体良性肿瘤，局限性恶性扁桃体肿瘤。扁桃体的病灶可以引起关节炎、肾炎、心脏炎、风心病，也要做扁桃体切除。有很多切除的方法，但很少用激光治疗，有时会用等离子，等离子低温消融，或者用电刀切除扁桃体。临床更多用等离子，因为其是低温消融、无痛。
以前常做无麻下扁桃体挤切术，现在医学进入舒适化治疗，要让病人没有痛苦，采取全麻下术后。当然用新技术等离子低温消融，其疼痛会减轻，如果用传统电刀做，疼痛会加重。