囊胚活检是做三代试管，也就是在胚胎植入前，针对其染色体进行筛查必须要做的步骤。将胚胎培养到囊胚阶段，然后取数个囊胚的滋养层细胞，将此细胞进行染色体或基因的筛查，或针对某个基因，如胚胎的父亲或母亲，存在某一条染色体的异常，或存在某种基因方面的疾病，可针对此类问题进行筛查，将异常染色体或含有致病基因的胚胎剔除，将正常的染色体，也就是没有携带致病基因的囊胚冷冻，然后进行囊胚移植，上述过程称为囊胚活检。
囊胚活检的目的是将活检的组织细胞进行染色体和基因检查，囊胚的活检通常取滋养层细胞，滋养层相对而言是发育为胎盘的细胞，对胎儿影响相对较小。虽然囊胚活检不是取胎儿的组织，但基本可代表胎儿的染色体以及基因状况，因此进行囊胚活检，是为进行囊胚本身的染色体或基因的筛查。
