男性感染HPV有相当一部分情况确实不需要治疗，如果没有病灶一般不需要治疗，自愈后不存在负面影响。但如果有病灶且不进行治疗，病灶会迁延不愈且有可能会越长越大。学术界对于男性的HPV是否需要治疗还存在一定的争议，目前主流观点是治疗男性HPV的主要意义是清除病灶，此病灶主要表现为生殖器官区域表面的各种疣状物，比如尖锐湿疣，此时便需要治疗，治疗的主要的手段是通过物理的方法将病灶清除掉。如果不治疗，病灶不会自己消失，且有可能在局部生根发芽扩大局灶。

但在实际工作中更常见的男性HPV感染是没有病灶，临床上医生仔细检查患者所有的生殖器官，表面没有任何的病灶。此时可以认为HPV并没有对患者造成明显影响，此时的主流观点是不需要治疗，且不存在负面的效果，患者自身的免疫力会逐步战胜HPV病毒，实现自我康复。所以男性感染HPV之后是否治疗，取决于病灶是否存在，如果有需要治疗，不治疗病灶会加重，如果没有不需要治疗也可以康复。