胸腔镜特有的并发症比较少，主要是进入胸腔镜器械的周围出血和疼痛，其它跟常规开胸手术类似。这些并发症包括肺炎、肺不张或肺部膨胀不全，包括心律失常，甚至有出血、血栓栓塞、切口液化、感染或支气管残囊瘘。

肺癌胸腔镜术后并发症与开胸类似，因为两者在手术操作过程当中以及手术步骤和切除范围、淋巴结清扫都相同。两者相比较，胸腔镜的并发症几率小于开胸，因为创伤相对要小、恢复要快，而且患者生活质量相对要高，逐渐为大家所接受。