如果患者的脑干梗塞病情程度轻，并且没有发生在重要功能区，没有影响神志、呼吸循环，经过积极治疗抢救，可以取得很好的治疗效果。但是这种情况属于少数，大多数脑干梗塞患者会有瘫痪、神智障碍的问题，重要的是脑干梗塞影响呼吸循环中枢后，会造成危险后果，并且在急性期2-3天内会出现生命危险。
通常患者在急性期需要经过一系列的抢救措施，以挽救生命，但是仍可能会留下后遗症，如瘫痪、感觉障碍、语言障碍、吞咽障碍等。患者应做好积极预防，做好一级预防，防止脑干病变。脑干梗塞发生以后，需要积极抢救、治疗，争取较好的预后，避免出现危险，以及严重后遗症，此外还应做好二级预防，防止病情复发。
