肠镜是比较好的检查手段，检查肠道没有危害。肠镜是否会带来并发症，理论上存在，但概率较低。绝大多数肠镜都很安全，能够顺利检查到肠道，早期发现息肉、炎症、肿瘤等病变，有助于挽救生命、健康。
肠镜会造成危害是因为肠道本身较薄，做肠镜的过程中，有千分之几的概率或万分之几的概率发生穿孔，即俗称肠子被捅破，这种还是因为局部病变或结构异常造成的情况。如果出现穿孔，一定要及时救治，通过及时的外科手术修补，能避免出现更加严重的并发症问题。
因为大多数肠镜都较安全，不会有危害，顺利完成的肠镜也不会造成后续肠道的肚子腹痛、功能改变。部分人做完肠镜后肚子不舒服，在头2天之内因为肠道检查过程中的注气，可能会有造成这种感觉，通常不会超过几天。
过完几天后，这种症状都缓解，不会引起危害，所以不要误会。总体上，肠镜是较为安全的检查。
