目前还没有什么治疗肾小管纤维化的特效药物，针对不同病因导致的肾小管纤维化，可能有不同的方案。比如针对马兜铃酸肾病导致的肾小管纤维化，有时在急性期可能会用一段时间的激素以及免疫抑制剂，如环磷酰胺类药物，主要是可以抑制一些细胞因子，通过抑制细胞因子，抑制肾间质的纤维化进展。还可以应用RAS系统的抑制剂，比如ACEI或者是ARB类的药物，比如沙坦类或普利类的药物，如缬沙坦、厄贝沙坦、培哚普利等，这类药物也可以从减少细胞因子的聚集等方面起作用，对肾间质纤维化有一定的改善作用。
此外，还可以用一些虫草制剂，比如冬虫夏草的一些中成药，认为在动物实验上有改善大鼠肾间质纤维化的作用，目前有一些动物实验的证据出现。总之，治疗肾小管间质，主要是不要再接触引起肾小管间质损伤、引起肾脏损伤的药物，是非常重要的一点。
