甲状腺功能亢进是内分泌疾病，通常挂内分泌科。一般内分泌科是给予药物治疗甲亢，当药物治疗出现不良反应的时候，比如肝功能下降、白细胞下降，或者肝功能损伤时，则不适宜口服抗甲状腺药物治疗，通常建议做碘-131的治疗。
如果患者需要做碘-131治疗甲亢，或者患者觉得口服药物的疗程比较长、定期复查比较繁琐，也可以选择同位素碘-131治疗，一旦选择同位素碘-131治疗，则要挂核医学科。如果甲状腺比较大或者合并有结节，需要手术切除甲状腺治疗甲亢的时候，则要挂外科。