失眠灸的穴位主要集中在肝、肾经任督二脉，有时也会灸膀胱经和脾经。首先，肾经灸的是涌泉穴，涌泉穴可以引热下行，可以使心火下行，心肾相交可以治疗失眠，失眠大部分是由心肾不交引起。可以灸百会穴，一般选择在白天灸，白天灸时头脑清醒，昼不精则夜不寐，白天如果昏昏沉沉，晚上更睡不着，白天精神比较好、思维敏捷，晚上容易睡着。
其次，治疗失眠还可以灸脾经上的穴位，比如足三里，经常有胃不和卧不安的病人，脾胃不和灸足三里、中脘穴、脾俞穴，可以治疗脾胃不和，从而可以治疗失眠。可以灸丰隆穴，很多失眠是由于痰浊内扰引起，灸丰隆可以祛湿、祛痰，此时能起到治疗失眠的作用。
