目前做的取卵手术绝大部分是采用阴道超声显像检测下的取卵手术，是一种安全、有效、相对简单的取卵手术。手术一般较安全，但也可能会存在手术风险，如可能会损伤邻近器官如肠管、输尿管、膀胱，甚至是血管而引起继发问题，如盆腔内出血。对于阴道壁或宫颈穿刺点少量出血，可以通过用纱布压迫止血或钳夹止血，必要时必须给予止血药来止血，同时进行严密观察，一般出血可以自行停止。如果发生大量不可控的内出血，需要急诊住院手术治疗。另外因为取卵手术是经过阴道操作，如果生殖器或者是盆腔存在炎症，取卵手术后就存在感染的风险，因此取卵手术后必要时要应用抗生素预防感染。
