绝大部分原发性甲状腺功能减退症不能治愈，甲状性功能减退是由于各种原因，造成体内甲状腺激素明显不足，或甲状腺激素不能发挥生物作用。根据发病部位，有原发性甲状腺功能减退，病变在甲状腺本身，也有继发性或散发性甲状腺功能减退，病变发生在脑垂体或下丘脑。90%以上的成人为原发性甲状腺功能减退症，造成这种疾病最常见的原因是甲状腺手术、甲状腺碘-131治疗或自身免疫性甲状腺炎。这三种原因占成人原发性甲状腺功能减退95%以上，但是此类原发性甲状腺功能减退，绝大部分不能治愈，需要长期、终身使用左甲状腺激素进行替代治疗。

但有部分病因造成的原发性甲状腺功能减退属于一过性，通过调整治疗或自我免疫功能恢复，病情缓解后也能得到良好控制，甚至痊愈，比如治疗甲亢的时候出现药物过量，引起药物性甲状腺功能减退，也属于原发性甲状腺功能减退症之一。通过调整并减少抗甲状腺的药物，这类疾病可以治愈。如果是产后甲状腺炎或亚急性甲状腺炎，也有可能在病程过程中出现一过性的原发性甲状腺功能减退，通过患者病情好转，一过性原发性甲状腺功能减退也能自愈。