一般小针刀治疗比普通的针刺要疼一些，小针刀与打肌注疼痛性质有点类似，基本上是在同一个级别上。
小针刀的针身要比毫针粗一些，毫针是0.3mm左右，小针刀是0.4-1.0mm，所以小针刀进到人体造成的创伤要比毫针更明显一些，针刀产生的疼痛感也会更明显一些。
小针刀的针身与注射器的针身基本上类似，所以疼痛感与打针时候的疼痛感有点类似，疼痛级别也会差不多，但是无论是抽血，或者是肌注、输液，实际上疼痛就是进去那一下。
而小针刀疼痛不是只有一下，因为小针刀需要在针刺部位进行切割、剥离，往往会有每个点3-4下，这样疼痛感会更明显一些，而且是一种酸胀疼痛感。因为扎到穴位上往往会产生针感，小针刀也是如此，因此酸胀疼痛会更加明显一些。
