肝结石严重与否取决于肝结石是否引起相关异常。如果肝结石数量比较少，没有引起相关的异常症状，以及没有异常的肝脏器质性病变，则不严重，定期复查随访观察即可，但要注意饮食调控。
如果肝结石数量比较多，或反复引起胆道感染症状，包括肝脓肿、肝内炎症、胆汁淤积等，这种情况比较严重，反复症状发作通常代表将来会引起更严重的风险和并发症，比如引起肝脏萎缩，甚至在远期引起肝内胆管癌。所以针对肝结石有反复胆道感染发作的问题需要进一步治疗，建议采取手术治疗，取尽肝内的结石，必要时做部分萎缩的肝脏切除，可以避免后期出现严重的风险和并发症。
如果全肝结石引起胆汁性肝硬化，这种情况比较严重，针对无法取尽结石的患者，就只能通过肝移植来达到有效的治疗。
