唇腭裂通常在怀孕的前3个月，即12周前形成，主要的形成时间为怀孕3-8周。如果孕产妇在怀孕期间缺乏维生素A、维生素B以及叶酸，均可能会导致胎儿唇腭裂。环境因素以及致病因素的作用，可能也是引起唇腭裂的主要原因。
孕产妇在孕期缺乏维生素A、维生素B、叶酸，或由于抽烟、喝酒以及食物过敏或有毒因素的作用，可能导致胎儿在发育的重要时期，即前3个月时导致胎儿唇腭裂。所以在怀孕早期建议孕产妇远离毒物、有毒环境或装修的刺激性气体，上述致病因素均可能会造成胎儿唇腭裂或其它畸形。在早孕期间建议孕产妇按医生嘱托积极补充叶酸，可以帮助预防神经管畸形以及唇腭裂。
