腱鞘囊肿形成在关节囊周围和腱鞘周围的局限性关节液或滑液聚积，往往是包膜里面包有液体，因此，腱鞘囊肿的消除需要这些液体吸收，或整个把包膜去掉。在临床上有腱鞘囊肿的病人，往往会建议患者在没有疼痛和其它症状的情况下，先进行一定程度的保守治疗和观察。因为临床上确实有一部分腱鞘囊肿有可能自行吸收和消失，观察期往往是在2-3个月，最多是半年。
如果囊肿持续性长大，或压迫了周围结构，出现麻木、疼痛等症状，恐怕自行消掉的可能性非常小。在临床上，有些医生会采取挤压的方式把囊肿挤破，来消除囊肿，只是把气球挤破，而气球的皮仍然留在身体里。
当这些滑液再次增生时，就有复发的可能性。因此，再消除的方法是进行外科手术。外科手术可以很清晰地解剖出腱鞘囊肿周围的结构，然后把囊壁彻底切除，同时切除产生囊壁的，即腱鞘周围部分腱鞘组织，或把破损的关节囊进行修复，这样复发率就会极大减低。手术同时还有好处，就是可以把切除下来的肿物进行病理检查，来除外其它疾病。因此，囊肿消除先要观察，然后再择期进行手术治疗。当然要符合手术指征。