继发性腹膜炎，最常见的致病菌是革兰氏阴性杆菌。革兰阴性杆菌里常见的是大肠埃希菌或者大肠杆菌，此为消化道的常见致病菌。
继发腹膜炎是腹腔内会有原发性的疾病，比如胆囊炎、消化道穿孔、阑尾炎、胰腺炎，或者绞窄性肠梗阻等原发性的炎症，这些原发性的炎症感染到一定程度，会继发壁层腹膜炎的炎症。
致病菌来源是原发性疾病的病灶位置，多见腹腔内常见的革兰氏阴性杆菌。 对于存在继发腹膜炎的病人，应该使用对革兰阴性杆菌比较敏感的抗生素，多数情况下应用三代头孢。
同时腹腔内器官可能会伴有厌氧菌的感染，所以在治疗继发腹膜炎的过程中，还要给予抗厌氧菌的药物，联合应用，对继发腹膜炎的治疗效果会更好。
