肝内胆管扩张引起的原因非常多，一般肝脏分泌胆汁后，通过毛细胆管汇合成小段或叶的胆管，胆管又逐渐形成左右肝管，肝管汇合成肝总管，再和胆囊管汇合后形成胆总管，把胆汁引流到十二指肠里。肝内胆管扩张有些是先天性的疾病，如先天性胆管扩张症，这部分患者是因为基因变异引起的，所以胆管有明显扩张。
还有部分患者是后天性引起，如肝外有阻塞，包括结石性的阻塞、肿瘤性的阻塞或者其他原因，如胆管下端的胰腺发生病变，阻塞了胆汁的通畅引流，造成胆管内压力增高，也可以造成肝内胆管的扩张。
所以肝内胆管扩张原因非常多见，要根据相应的原因进行相应的处理。一般先要进行相应的影像学检查，如超声、CT、核磁检查，判断胆管扩张是局限于肝内胆管，还是肝内外胆管都有，或肝内外胆管有异物，或者是局部压迫造成，根据这些影像学判断来进行相应的治疗方案的选择。
