卵巢囊肿穿刺手术，通常有比较严格的限定条件才能做，穿刺手术过程可以在手术室进行，也可以在门诊手术室进行，大部分需要窥器在阴道里操作，也有个别患者需要在腹部进行穿刺操作，但均需要在B超监护下操作。

阴道囊肿穿刺，通常在B超监护下打开窥器，在宫颈后面的穹窿部位，用一根细针进行穿刺，通常穹隆部位在B超底下可以观察到，是离囊肿最近的地方，且中间没有肠管阻隔，不会穿透肠管，从这穿过去将囊肿里囊液放出，便于检测囊液性质。通常在囊肿扭转情况下，才会进行穿刺囊液，减轻囊肿扭转，保护卵巢，避免出现卵巢坏死的情况。