甲沟炎发作期，尤其是感染、渗出较明显时，患者可以口服头孢类抗生素，头孢类药物具有一定的抗感染作用。但治疗甲沟炎，除口服抗生素外，患者还需要其它治疗方法进行辅助治疗。
甲沟炎主要是细菌感染，感染可以在局部形成积聚又难以引流，形成局部的感染病灶，并反复存在、复发。因此患者在急性发作期，尤其是炎症的红、肿、热、痛、流水期，可以使用抗生素，包括使用头孢类药物进行治疗。头孢类药物在抗感染方面，具有比较广泛的敏感性和杀菌力。
头孢类药物虽然对控制炎症有较好的帮助作用，但是仍然有其局限性，因此甲沟炎的治疗不能完全依赖于药物。甲沟的独特性是炎症不容易引流而容易复发，因此需进行甲沟的局部消毒，以及伤口引流，同时避免指甲受压并保持局部干燥。
上述方法综合运用可以更好处理甲沟炎，对症处理的同时，能够尽量避免甲沟炎的复发。
