体外冲击波碎石治疗是结石治疗的重要组成部分，由于体外冲击波碎石创伤小、可以在门诊治疗等优点，广泛应用于结石的治疗。体外冲击波碎石治疗虽然是个微创的治疗手段，但是依然存在一些风险。

风险主要包括结石的粉碎以及排出的情况，在排出的时候可能会形成肾绞痛症状。患者会感到局部的疼痛，在排出的过程当中，可能会有结石的残留，甚至严重的时候会有结石石街的形成。

这和适应证选择的结石大小有较大的关系，所以肾结石治疗适应证选择一般是＜2cm的。对于鹿角形结石，形成石街的概率高达40%，这为后续的处理带来困难。

另外，就是感染的问题，在肾结石的碎石治疗后可能会出现尿路的感染情况。严重的时候可能会出现脓毒血症，要积极进行强有力抗生素治疗以及引流尿液的处理。

结石的损伤当中先是肾脏的损伤。肾脏的损伤包括肾脏包膜下的血肿以及肾脏破裂，甚至肾脏局部的瘢痕、纤维化形成，影响肾脏功能的问题。同样可能会对周围的器官形成损伤，比如消化系统的肝脏损伤和脾脏损伤、胰腺损伤等。

在心血管方面也可能有负面的影响，一般不建议有心血管疾病的人行体外碎石治疗。是否引起高血压、糖尿病目前仍存在争议，建议进一步的研究，总结这方面的资料。