新型冠状病毒肺炎和扁桃体发炎是不同的疾病，两者之间常见的区别如下：

1、病因不同：新型冠状病毒肺炎是新型冠状病毒引起的疾病状态，而扁桃体发炎多数是细菌所引起，比如溶血性链球菌、葡萄球菌等；

2、症状不同：扁桃体发炎症状通常比较局限，通常是在咽喉部，比如出现急性的扁桃体炎时会出现急性的咽痛、发热等症状，慢性的扁桃体炎表现为咽喉部不适以及慢性咳嗽。而对于新型冠状病毒肺炎，除有咳嗽、发热的症状外，通常还有乏力、肌痛，随后可以出现呼吸困难等症状，尤其是新发现的德尔塔病株引起的新型冠状病毒肺炎，容易发展成重症疾病，重症病人通常具有呼吸困难的表现；

3、实验室检查不同：扁桃体发炎一般伴有白细胞总数和中性粒计数增高，而新型冠状病毒肺炎，白细胞总数处于正常或降低水平，同时淋巴细胞数目会降低；

4、其他不同：新型冠状病毒肺炎病人在进行CT检查时发现有磨玻璃，但扁桃体发炎的患者CT检查比较干净。对于治疗，新型冠状病毒肺炎需要抗病毒治疗，而扁桃体发炎需要抗细菌治疗。