宝宝如果只是单纯的房间隔缺损，没有合并其它心脏结构和功能的异常，同时又没有相关的免疫缺陷或者染色体疾病等异常的免疫状态，可以接种正常的疫苗。但是有部分房间隔缺损的宝宝抵抗力比较弱，在接种疫苗之后容易引起疫苗接种的反应，比如发热、皮疹，或后期引起相关的不良反应等，所以有部分疫苗接种对于房间隔缺损的宝宝比较慎重，甚至在畸形矫正之前可能无法按时接种相关的疫苗。 但是有部分房间隔缺损可以自愈，随着时间的发展房间隔缺损如果逐渐自愈，也可以进行相关的疫苗补种。
还有个别宝宝后期房间隔缺损，可以通过介入手术或者先天的心脏外科修补手术，进行先天畸形的矫正，矫正之后心脏结构和功能就可以恢复正常，此类宝宝也可以进行正常免疫的补种，或按时、按期的正常接种疫苗。
