百合银耳莲子汤的作用是润肺养阴、健脾益气，主要用于呼吸道的疾病。中医认为热证后期，疾病快要痊愈时，前期症状比如发烧、嗓子疼、咳嗽以及黄痰等证候都消退后，如果还会有比如干咳、嗓子干、说话多了以后就想咳嗽，或者遇冷、遇热总觉得嗓子里有呛的感觉，则是肺阴虚的表现，此时应该养阴润肺。但是养阴润肺的药都偏凉，脾胃不好吸收，尤其是得了热病后，用过抗生素、退烧药等，都很伤脾胃，此时患者又想滋阴，又想保护脾胃，就可用百合银耳莲子汤。
百合和银耳都有凉、润的性味，对肺的肺阴损伤有恢复作用，其中又加了莲子，莲子入脾经、健脾益气，还调和脾胃，能帮助恢复用药以后导致的脾胃损伤、脾气不足，同时也对肺有保健的作用，中医讲脾是肺的母脏，所以健脾的药对肺也有好处。所以以上三个食材搭配起来，能共同起到润肺健脾的作用。
