经期艾灸小腹，主要的作用是温经通络、活血化瘀、止痛。小腹部有很多治疗女性月经疾患的穴位，比如气海穴、关元穴、天枢穴、中极穴等等，刺激这些穴位可以通经活络，从而可以治疗月经不调、痛经。而艾灸本身也有温经通络的作用，如果二者相结合，在经期艾灸小腹部，则可以有效缓解经期的疼痛，即痛经。同时由于具有很强的活血化瘀作用，所以在经期当中可能会看到有血块，属于正常情况。
另外，无论是否处于经期，对于小腹部，即气海穴、关元穴等穴位的艾灸都有助于活血化瘀、温经通络。如果经常痛经的人，在月经即将来潮之前7天或者10天左右开始对小腹部进行艾灸，对痛经也有一定的预防作用。
