内源性抑郁的治疗分为两大类，具体如下：

一、药物治疗：

内源性抑郁通常有比较明确的躯体不适的特点，同时很可能伴有自杀的观念，所以这个时候内源性抑郁可能对于大部分的抗抑郁药反应很好。换句话说，内源性抑郁的一个特点就是抗抑郁药的疗效反应不错，所以这时一般都会建议患者药物治疗。内源性抑郁如果患者的程度比较重，通常会首选药物治疗；

二、非药物治疗：

1、物理治疗：对于药物治疗以外，可能还会有其他的治疗方法，比如对于有比较强的自杀观念的患者，或者是内源性抑郁比较重，很重的躯体不适，比如患者拒绝吃东西，拒绝交谈这种症状很重的时候，可能会进行一些物理治疗，比如电休克治疗；

2、心理治疗：除了物理治疗以外，会建议合并一些心理治疗，尽管内源性抑郁的发生更多与生物学因素有关，对于药物的反应更好，不能除外这个患者有社会心理因素，还是会给患者辅助一些心理治疗，积极的宣教，疾病的解释，至少让患者对这个病有科学的认识，也帮助自己更好地去调节以及预防以后的复发。