儿童是食物不耐受的主要人群，由于儿童在年龄较小时存在较弱的免疫力，和薄弱的消化系统，在添加辅食后更容易存在食物过敏的情况，对异体蛋白存在不耐受。儿童的食物不耐受是否随着长大能得到有效的控制或者改善，取决于早期食物不耐受的管理和干预效果。如果儿童早期食物不耐受，做到早发现、早干预，严格进行阳性食物的忌口，避免加重或病情反复，随着儿童年龄的增长，免疫力和消化能力的提升，对不耐受的食物会逐渐耐受，或者不耐受的症状控制在合理范围，基本可以达到治愈的效果。
如果儿童早期的食物不耐受没有得到较好的重视，听之任之或不进行阳性食物的饮食干预，不断加重不耐受的情况。随着儿童年龄的增长会出现新的变化，从之前单一的皮肤、消化道症状，演变为呼吸道症状，比如鼻炎、哮喘迁延而且难治愈，甚至成为伴随终身的不耐受体质。因此儿童在有食物不耐受情况时，应该遵医嘱及时治疗，避免对儿童的生长发育产生不良影响。
