智齿长不出来被肉包着疼，通常情况下是智齿冠周炎。智齿冠周炎是指智齿牙冠周围的牙龈发生炎症，这种智齿冠周炎存在的原因是智齿阻生即智齿长不出来。长不出来的智齿外面因为包着一层牙龈，肉跟牙龈之间会有缝隙，缝隙会储存食物，并且容易发生损伤，因此感染避免不了，炎症或轻或重，在炎症重时会出现疼痛，解决的根本方法是拔出智齿。