甲硝唑片可以治疗鼻窦炎，鼻窦炎大部分属于细菌感染，细菌感染大部分是有氧菌，以肺炎链球菌多见，用药时通常首选头孢、大环内酯类抗生素，或者青霉素等。但有时鼻窦炎感染不单是有氧菌，还可能是厌氧菌，如果有厌氧菌感染时，使用甲硝唑片可以使炎症得到较好地控制。因此，如果使用头孢或大环内酯类抗生素治疗不见好转时，则会考虑加用甲硝唑片配合治疗。
甲硝唑片对厌氧菌感染的治疗效果较好，所以在常规治疗无效的情况下，可以加用甲硝唑片治疗鼻窦炎，也可进行细菌培养，通过细菌培养的结果，明确引起鼻窦炎的主要病原菌。如果没有厌氧菌，可能加用甲硝唑片后不会有明显效果。鼻窦炎治疗时，对于抗生素的应用，首先根据经验进行治疗，其次如果经验治疗无效，可以通过细菌培养，更加精准地指导用药。
