排出仅有黄水的时候可以做肠镜，当然最佳的情况是到清水，而且最好是不带粪渣的清水，此时证明肠道准备非常充分且彻底。充分的肠道准备，有助于做肠镜检查的时候，清晰地观察到完整的肠道黏膜，有助于发现病变，避免遗漏。
做肠镜检查前，常规都要做肠道准备，即要喝洗肠的药物，现在临床上比较常用的洗肠药为复方聚乙二醇电解质散，通过大量地喝水配合药物，就可以把肠道清洗干净。良好的肠道准备就是指在进行肠道准备的时候，一定要排到没有粪滓，最好是清水，部分人排的是带黄颜色的水，只要没有明显的粪渣，都可以进行肠镜检查。只有做了良好的肠道准备，肠镜进去的时候才不会看到粪渣或粪水的残留，尤其是粪渣覆盖在肠道的黏膜表面，就会影响对肠黏膜的观察，可能会导致遗漏病变。
