精子主要是在附睾和精囊两个部位储存。睾丸内有很多的曲细精管，就像一个漫长迂曲的生产线，每时每刻都在生产精子。
当精子形成半成品，会先运输到睾丸外上方的附睾位置，逐渐成熟，成为一个合格的产品。然后再沿着输精管运输的管线，一直运送到在前列腺后下方的精囊储存起来，即精囊储存已经成熟的精子。
射精时，精囊腺剧烈收缩，把里面的精子喷射而出，但喷射出的精子只占全体精液的不过5%，另外90%以上液体成分来自于前列腺液，以及尿道球腺、尿道旁腺所分泌的液体，所以精液其实是一个混合液。
如果有性活动、手淫或遗精，精子都会被射出。如果精子没有出来，其实也不必担心，因为无论在附睾，还是在精囊，人体都有自吸收机制，过期的没有被排出去的精子会被人体自己消化掉。
