做近视眼手术后会留下后遗症。因为近视眼手术，只是将眼镜做到角膜上，通过改变角膜的曲率而达到矫正视力的目的，由于角膜进行切削，角膜的厚度会变薄，留下的后遗症是抵抗力减弱。在外伤的情况下，正常人还未发生眼球破裂，而做过近视眼手术的人群可能已经发生角膜的破裂伤，是由于做完矫正近视眼的手术以后，角膜变薄的原因。

做近视眼手术只是改变角膜的曲率，并没有改变眼球的长度，在于眼底同样会有高度近视眼所引起的疾病，如视网膜脱离或者视网膜裂孔的风险，周边部位可能存在视网膜变薄、变性的区域，所有高度近视眼所存在的危险，对于做近视眼矫正手术的患者仍存在，只是不需要戴眼镜而已。