小儿化脓性扁桃体炎一般病程为七天，意味着在这七天的病程中，必须给患者充足的抗生素和充足的辅助治疗，如护理、局部治疗。扁桃体发炎以后，会引起发烧、嗓子疼，小孩还会引起高热、惊厥等症状。对于扁桃体治疗，不能嗓子不疼情况好了就停药，一定要把药用够，时间治疗够，才会保证安全性。
如果治疗不够，扁桃体会发生并发症，常见的有局部并发症或全身并发症，局部并发症需要到两周以后显现出来。不是每一个患者扁桃体化脓以后都会发生并发症。如果发生并发症如扁桃体周围炎，一般都是两周以后。小儿化脓性扁桃体炎最关键的是抗生素要用足量，抗生素用的时间也得足够，抗生素的用量或治疗时间都要足疗程，不然以后会发生并发症或严重问题。
