地衣芽孢杆菌活菌颗粒主要具有调节胃肠道菌群的作用，进入体内后能够促进胃肠道有益菌的生长，比如对双歧杆菌、乳酸杆菌等有益菌，都有促进生长的作用。另外，可以对有害菌具有杀灭作用，比如大肠埃希菌、金黄色葡萄球菌等致病菌，具有杀灭作用。
地衣芽孢杆菌活菌颗粒还能够产生一定的夺氧效应，使胃肠道处在缺氧的条件下，促进有益的厌氧菌繁殖，同样也起到调节肠道菌群的功效。还能够促进具有杀菌活性的物质释放，也起到一定的抗菌作用。临床上主要用于病原菌感染所导致的腹泻，起到调节菌群的功效，还可以用于其他原因导致的胃肠道菌群失调。
地衣芽孢杆菌活菌颗粒属于活菌制剂，存放以及使用药物时不能放置高温处。如果需要溶解服用的时候，也不能用高温水进行溶解，水温一般不超过40℃。同时还不能和制酸药以及抗生素同时使用，如果确实需要使用，应该至少间隔3小时左右。
