藿香正气水作为经典药物，在很多领域都有较好的应用，但用其去除脚气并不科学，可能因藿香正气水含有酒精的缘故，所以认为其可能有一定的去除脚气的作用，但实际上酒精无法杀灭真菌，所以并不是一个好方法。
脚气有较好的抗真菌药物，如达克宁、盐酸特比萘芬乳膏、硝酸镁、氟康唑软膏、酮康唑软膏、环吡酮胺软膏，均为治疗真菌感染有效的药膏，故治疗脚气可选择便宜且效果佳的抗真菌药膏。但脚气易复发，一个原因是足部微环境潮湿温暖，易滋生真菌感染。
另一个重要原因是抗真菌感染的药膏，建议延长治疗时间，通常1-2周后脚气即好，不痒且不脱皮，若此时停止用药，实际上真菌还未被杀死，其生长周期很长，则较易复发，所以通常推荐外用抗真菌药膏的治疗方法，持续使用3个月彻底去除脚气。
