肝脓肿可以分为三个分期，分别是急性感染期、肝脓肿期以及愈合期。细菌通过相关的通道进入肝脏，比如胆道、肠道、动脉、静脉、淋巴管，在肝脏内定殖，这种情况下，引起了急性感染。

在感染期，主要是处于炎症病灶的过程，这个时间并没有脓液的形成，在初期就需要及时给予广谱的抗生素。如果有出现血液感染或者败血症的情况下，则需要根据培养的结果，进一步明确感染的病菌，以便采取药物敏感试验，给予敏感的抗生素治疗，能够获得良好的疗效。

有可能针对部分小的脓肿，并不会成脓，而针对一些大的脓腔，如果没有及时给予处理，将会使炎症病灶逐步转变成脓性病灶，脓腔内积累脓液，有可能是部分化脓，也有可能是全部化脓。这种情况下，如果脓液无法吸收，需要进行穿刺治疗。

穿刺是经过皮肤肝脏，将脓腔内的脓液吸出，这种情况下能够有效地促进脓肿的恢复。某些必须的情况，还有可能需要手术治疗，才能达到根治的目的。经过穿刺以后，脓液清除，逐步进入了愈合期。整个肝脓肿出现萎缩，并且逐步通过疤痕性的愈合。

一般时间小的脓肿可能需要2-3周，而大的脓腔可能需要1-2个月，有的甚至需要半年才能逐步愈合。在愈合期一定要定期复查、随访，以观察脓腔的大小，以及是否仍然有积脓、是否需要进一步的处理。