肝内的胆管结石无法通过吃药排出体外，胆管分为肝内胆管和肝外胆管，如果是在胆管下段的结石，可能通过吃利胆药物，比如胆汁胶囊、消炎利胆片、硫酸镁，促使结石排放到十二指肠。但是如果是肝内的结石，基本上不可能通过吃药的方法排出。
肝内的胆管走行非常复杂，基本上不能通过吃药，把每个分支的胆管结石排出。另外胆管里面结石以胆色素结石为主，是泥沙状或者淤泥状的改变，它的黏附度很强。即便是在手术当中，通过取石钳取石都非常困难，不一定能够把结石取干净，甚至还要做肝段的切除， 在术后反复做几次胆道镜的取石，才可能把石头取干净，所以肝内胆管结石最好的治疗方法是通过手术治疗。
