患者进行幽门螺杆菌碳13呼气试验，判定有无现症感染的情况，正常值一般是0-3.9，检测结果判定为阴性，若超过3.9，判定结果为阳性。但幽门螺杆菌碳13的呼气试验，会受到患者服药的影响，亦会存在假阳性，以及假阴性的可能。如近期服用质子泵抑制剂类药物，因胃肠炎或牙疼服用消炎药，均会影响碳13的检测结果。
因此一般建议患者根除幽门螺杆菌治疗，结束之后，停药1个月以上的时间，再复查碳13的呼气试验。若患者服用质子泵抑制剂或消炎的药物，要停药至少2-4周以上再复查，使碳13的检测更加准确。另外进行幽门螺杆菌碳13检测时，要空腹的状态。
