艾普拉唑和奥美拉唑的区别，主要在于代谢途径。无论是艾普拉唑还是奥美拉唑，都属于质子泵抑制剂，主要作用是抑制胃酸分泌，它们都属于苯并咪唑类的结构以及它的衍生物。

临床上经常用到的质子泵抑制剂，包括奥美拉唑、雷贝拉唑，还有兰索拉唑、泮托拉唑等，主要经过肝的药酶系统P450的代谢系统，经CYP2C19酶代谢。

若同样服用经过CYP2C19酶代谢的药物，可能会影响到药物代谢，导致血浆中的药物浓度出现变化，可能会带来一些治疗上以及不良反应上的差别。

人的CYP2C19酶存在基因多态，基因多态带来的临床影响，主要是不同人的药物代谢速度不一样，如快代谢型、中间代谢型、慢代谢型，对于快代谢型的患者，如果服用相同的药物剂量，可能临床疗效就会受到一些影响。

通常在处方这一类药物的时候，一般不会建议每个病人都做CYP2C19基因多态性的检测。

如果希望(药物)的抑酸效果比较好，就会尽量选择受CYP2C19代谢影响小的药物，如艾普拉唑，该药物主要由3A4代谢，其代谢途径和奥美拉唑不一样。