目前白塞病的病因以及发病机制尚未完全明确，白塞病的发病可能和以下几方面因素有关：

1、遗传因素：研究发现人类白细胞抗原-B51基因在白塞病患者当中的阳性率升高，这种病的发病可能与遗传有关；

2、感染因素：部分患者的结核感染、链球菌感染发病的情况较为常见；

3、环境因素：白塞病的发病主要出现在丝绸之路周边国家，这一地区的发病率明显增多，所以通常认为此病的发病和生活环境有一定关系。

目前认为此病的发病机制是由于患者在各种发病原因的作用下，出现免疫系统功能异常的情况。这种免疫异常包括细胞免疫异常、体液免疫失常，部分患者可以出现中性粒细胞功能亢进的情况，同时有血管内皮细胞损伤和血栓形成。免疫系统针对这些自身器官和组织会产生免疫反应，导致相应的组织、器官出现炎症以及破坏的情况，出现白塞氏病相关的临床症状。例如口腔溃疡、外阴溃疡、眼炎等相关临床表现。