脑血栓后遗症需积极控制脑血栓危险因素，主要是高血压、糖尿病、高血脂。同时需用抗血小板聚集药物，如阿司匹林、氯吡格雷等预防脑血栓并治疗脑血栓后遗症。还有稳定斑块的药物，如阿托伐他汀、瑞舒伐他汀，也可有效改善血液循环而稳定斑块，从而起到治疗后遗症和稳定斑块的作用。
除外，可用中成药，如血塞通、三七通舒胶囊以及银杏叶片，预防和治疗后遗症症状。还需通过饮食习惯调整，如低脂、低糖、低盐饮食，需进食优质蛋白质和不饱和脂肪酸，如海产品，包括鱼、虾 、蟹等，还包括鸡蛋、瘦肉、鸡鸭肉等。同时需进行运动，主要以氧运动为主，包括快走、慢跑、游泳等，均可有效改善血液循环，预防脑梗后遗症。
