针灸与艾灸并不冲突，即针灸的同时可以进行艾灸。因此若需分时间前后，针灸后当时便可以进行艾灸。针灸主要起到通经活络、调和阴阳、疏通气血作用，相对较平和，以通、调为主要功效。而艾灸为热性治疗，具有温通经络、回阳、助阳及活血化瘀作用，活血化瘀作用主要在于温热，造成气血循环加快。因此艾灸与针刺通经活络作用较不相同，两者完全可以结合使用。

临床有种治疗称为温针灸，即将针刺入人体后，在上方插入一段艾条，点燃艾条。在针刺同时进行艾灸，对寒湿性疼痛有较好的治疗效果，常用于治疗类风湿性关节炎，效果较好。因此针刺、艾灸可同时运用，部分情况下若患者较不方便，可针刺后选部分特殊穴位进行艾灸。