紧急避孕药不容易导致宫外孕。现在大样本临床分析，口服紧急避孕药与不口服紧急避孕药的病人，发生异位妊娠的可能性一样，理论上口服紧急避孕药并不增加发生异位妊娠概率，但紧急避孕药会抑制受精卵着床，这种情况影响进入宫腔，如果形成受精卵，可能异位其他位置。
因此；从紧急避孕药的说明和药物机制观察，其实容易引起宫外孕。病人可以口服紧急避孕药防止非意愿性妊娠，但是避免将紧急避孕药作为常规的避孕方法，因为紧急避孕药含雌孕激素比例要比短效避孕药高，因此对于卵巢功能及子宫内膜和输卵管内膜的干扰比较大。
如果常规口服紧急避孕药进行避孕，容易出现卵巢功能失调，引起月经失调，以及子宫内膜不规则增生。紧急避孕药相对副反应较大，有可能影响孕卵游走和孕卵着床，这种情况有可能会引起宫外孕。因此若偶尔在没有预料的情况下发生性行为，可以口服紧急避孕药，但避免将紧急避孕药作为常规避孕方法。
